杭州过去有十座城门，设满城后主要城门变成了六座，其中又以武林门、钱塘门、清波门、涌金门四座城门最重要。
浙江提督哈尔库部并总督标营守武林、钱塘二门，驻防副都统安珠琥领旗兵2000并湖州绿营1200人守清波门，副都统乌纳哈领旗兵1400并嘉兴绿营1600人守涌金门。
城中其余清军由杭州将军图喇统一节制，随时支援各门。
耿军兵临杭州以后，即在大都督曾养性指挥下开始攻城。
在曾养性安排下大将徐万耀领8000人攻打钱塘门，总兵王世瑜领兵9000人攻打清波门，总兵王振邦领兵7000人攻打涌金门。
其余主力25000人由大将江元勋指挥攻打武林门。
也就是武林门为耿军主攻城门，其余方向均为牵制性的佯攻。
另总兵蒋和等领兵万余外围警戒，不使清军的援兵抵达。
耿精忠完全同意曾养性的安排，为给将士鼓气亲自与曾养性于武林门观战。
为能一举破城，曾养性将军中包括6门红衣炮在内的各式铜铁炮180余门尽数交给江元勋。
耿家同孔有德、尚可喜一样均出于前明登莱新军，降清后被清廷称为“天佑兵”，因此对火器十分重视。
耿精忠归藩后更聘请大量荷兰人帮助训练耿军，又瞒着清廷从荷兰人手中秘密购得新炮数十门，耿军之中甚至有200多荷兰雇佣兵。
荷兰方面对帮助耿家是积极的，原因是当初正是耿家出面邀请荷兰人共同对付郑家，且耿家对于海贸格外重视。
起兵后耿精忠曾派人同荷兰人联络，请其能够出兵出战，条件是推翻清廷后荷兰人可以在耿家控制的沿海地区入港贸易。
双方甚至可以联合对付台湾郑家。
荷兰东印度公司实力很雄厚，拥有超过150艘大型战船，40余艘领先的三桅战舰，分布在东方各地的员工就多达五万余人，公司另外还有一万多雇佣兵。
虽然无法同东亚真正的海霸王郑家对抗，但在东南亚地区荷兰人是当之无愧的老大，同时东印度公司对败给郑家一直耿耿于怀，始终想重新回到台湾。
因而接到耿家的请求后，东印度公司高层很是心动，但这么大的事必须国内同意，而且他们也不想在中国反抗势力没有彻底压倒鞑靼人之前就下注，所以一方面推脱出兵需要国内同意，另一方面则尽量满足耿家的军事需求。
即向耿家出售火器，并派遣教官和技术人材。
自身火器装备数量足，降清之后耿军又一直在南方征战，士卒皆精锐，此次又是号称十万之众围攻杭州，世子更许下破城可纵兵洗劫满城，故而耿军士卒的士气之高远非城中清军可比。
琉球方面对耿军的硫磺支援也让耿军不再担心火药短缺。
实际指挥攻城的江元勋底气十足，下令炮兵对武林门炮击了足足一个多时辰，导致武林门一带部分城墙出现松动和坍塌。
隆隆炮声甚至十几里外都能听见。
城中浙江提督哈尔库看出耿军主攻方向是武林门，亲自于此门坐镇，由于城中火炮数量不多，因此哈尔库没有浪费火药同耿军对轰。
炮击结束后，江元勋立即组织人手开始负土填埋武林门外的护城河。
杭州护城河开凿于唐代和五代，都连通京杭大运河和钱塘江，虽然河面并不宽，但填河也相当困难。
当年清军入关后遇到有护城河守护的明朝重镇，大多强行驱使汉人百姓背泥填河，耿军也不例外。
早在进军杭州途中时，曾养性就下令将沿途百姓裹挟从军，目的就是让这些百姓充当耿军的炮灰。
一路过来足足裹挟了两万多百姓，多是绍兴、萧山一带的穷苦百姓。
加之耿军军纪很差，使得浙江百姓对他们极为憎恨。
当初清授剿总兵李荣能在金华重创耿军，靠的就是当地百姓为清军提供情报，使李荣能在耿军抵达前及时部署埋伏。
虽然耿军之中有人提出应当善待百姓，毕竟江浙这一块将来是他们的地盘，若是百姓离心离德，他们岂能长居久安。
然而世子耿精忠却视百姓生命为草芥，只要能拿下杭州他才不在乎死多少百姓。
其对几位大将说过那么一句:“若因痛惜百姓而事败，将来谁痛惜我们？”
在耿精忠的支持下，曾养性更是放开手脚，再无顾虑。
随着大将江元勋一声令下，近万被耿军抓来的百姓分成若干队从营中冲出，人人背上皆负一袋泥土或背一石块，在鼓声中硬着头皮冲向远处的护城河。
虽然知道城上的清军肯定会射杀他们，但这些百姓没有选择，他们不去的话身后从福建来的叛军也会杀他们。
城上清军知道耿军这是想让百姓替他们填平护城河，也是丝毫没有犹豫就向涌近护城河的百姓开炮。
一颗颗实心炮弹砸在密密麻麻人群中，当场被砸死的就有上百人。
倒下去的就倒下去了，没倒下去的在人潮带动下继续往前冲去。
眼见耿军驱使的百姓已经冲到护城河边，城墙上的清兵放铳的放铳，放箭的放箭，