宋州发生瘟疫的消息随着信鹰展翅飞翔，不久便传到了长安。
这也是郭宋没有想到的情况，他还以为双方会对峙一两年，没想到才几个月，竟然由疫病结束了这场战争。
但郭宋更关心的是疫病本身，朱泚大军会不会把疫病带到汴州？疫病会不会在宋城县内爆发，再由宋城县百姓把疫病带到附近州县，甚至带到难民营内。
想到疫病会在难民营内流行，后果简直不堪设想，郭宋便心急如焚，他当即传令给李冰，命令他采取一切措施，阻止疫病传播，同时命令江南、江淮各地全力收集石灰，用船只运往兖州和亳州，同时在江淮、江南征集数千名有经验的医师，支援兖州和亳州。
政事堂内，郭宋和七名相国紧急商议应对之策，众人你一言我一语，纷纷提出自己的见解。
“殿下，我觉得有必要设立半路隔离营和观察营。”
潘辽参与过十几年前在河西防治瘟疫的斗争，有丰富的经验，他知道隔离最重要，关键是不能让病人进入健康人群，那么必须要将所有人群进行无病甄别。
“还必须派出大量骑兵拦截难民，把他们驱赶去隔离营和观察营。”
郭宋望着地图道：“真有点防不胜防了，一旦汴州和曹州有人被感染，逃往兖州怎么办？必须把向难民营向东和向南撤离，还要寻找有效的药来预防疫病。”
相国张谦逸在一旁道：“殿下说得对，预防很重要，要告诉百姓勤洗手，水烧开了喝，最好吃饭之前把碗筷煮一下，上厕所要远离居住地，把这些习惯做好，就能大大降低疫病传播。”
郭宋负手走了几步，果断道：“我们要立刻做以下几件事，第一，在宋城县百里外建立东西南北四座隔离营和观察营，派五万骑兵赶往亳州和兖州进行支援。
第二，把两座难民大营迁到淮河以南的楚州，建五座难民大营，动员江南、江淮所有船只进行搬迁支援。
第三，朝廷拨出五十万贯钱向各地购买药材。
第四，开始向楚州运送物资，包括长安所有的储备帐篷。
第五，立刻停止黄河、淮河和长江摆渡，除了前往楚州支援的船只。
第六，封锁边界，严禁汴州、滑州、曹州百姓进入我们的领地。”
杜佑立刻反对道：“殿下，封锁边界不妥，会造成这三州严重的人伦灾难，应该派军队引导他们去濮州，在濮州建立新的难民大营，我们通过黄河运送物资去濮州。”
“微臣支持杜相国的意见！”
曹万年道：“可以在濮州边界建立隔离营和观察营，确定没有染病才能前往濮州难民大营。”
郭宋摆了摆手，“大家都说说吧！我们把所有意见汇总起来，分成急、重、缓三种方案，然后分步实施。”
众人一直商议到了深夜，终于草拟出了一份详细的计划，他们的细节中甚至考虑到了如何把兖州的煤炭也运往楚州大营，作为烧水的燃料，最后由郭宋任命右相潘辽出任指挥使。
大家都意识到这次疫情影响重大，如果处理不好，会给朝廷带来长期沉重的负担，朝廷必须全力以赴抗疫。
次日上午，随着郭宋的一道道手谕飞往亳州和兖州，飞往江南和江淮，各地开始紧急行动起来，兖州和亳州的两大难民营一百多万难民开始沿着泗水和汴水向南方撤离，声势浩大壮观，与此同时，江淮和江南上万艘船只北上，运送物资、粮食和老弱妇孺。
杨猛率领一万五千骑兵进入宋州，在宋州南面和东面建立了两座大营，这两座大营再继续细分为二，一座是隔离营，一座是观察营，有病症直接进隔离营喝药治疗，没有病症则先进观察营，三天无恙，则可以继续南下。
以此同时，李冰派大将张文涛同样率一万五千骑兵进入宋州，在北面和东面建立了隔离营和观察营。
李冰知道并非危言耸听，他已经得到消息，宋城县的情况很不乐观
宋城县并没有因为仇敬忠的一把火而幸免于难，疫病还是在军队中爆发了。
病源并不是在帐篷或者粮食上面，而是参加拆帐、搬运的士兵们大量私藏了在后军大营内捡到的财物，他们都带了一丝侥幸心理，贪婪战胜了疫病的恐惧。
而另一部分士兵在拆除大营时就感染，所以军营内的疫病并非接连爆发，而是同时爆发，上千名士兵发作了疫病。