“阿斯蒂，她在我身边长大，几乎没有接触过实验室之外的世界。她决定成为一个母亲，为了让自己的孩子变得有价值，擅自篡改了你的基因，让你成为了一个完美的受试者。”
“她以为只有这样才能让你出生在这个世界上。是我没有早早告诉她——生命在诞生之初就有了意义，她子宫里的生命不需要用价值去衡量。”
原来是这样。
宫纪从赫雷斯的话里补全了又一块拼图。
二十三年前或者更早，阿斯蒂遇到了身为考古学家的父亲。发现自己怀孕后，为了让“宫纪”诞生，阿斯蒂让“宫纪”成为具有研究价值的样品。
二十三年前，0号出生了，组织的人发现了阿斯蒂的爱人。就在这一年，父亲车祸死亡，阿斯蒂发了疯。
Gaea计划的变故之后，组织对第一实验室实施分权。朗姆开始在外部建立更多正规实验室，招揽大量研究人员。
二十二年前，宫野夫妇加入组织。
但是。
宫纪抬头看向上方，金属严丝合缝地镶嵌，将所有人关在这个钢铁堡垒里，走出这里的人要经过繁琐的报备和彻底的检查，通过两道关卡，被堵住耳目带到组织可控的地方去——这么多年来，从不出错。
所以，母亲到底是怎么遇到父亲的?
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“自从库拉索谈到宫警视和组织的渊源后，公安一直在暗地里调查宫警视的父母。”
这间会议室有且只有三个人，窗户大开着，风灌进来，撑起冷淡的窗帘。矢川明走进房间，从文件夹里抽取出一份资料，沿着会议桌滑向柯南和赤井秀一。
“为了不让组织发现端倪，我们的调查非常小心。相应地，进度也很慢，到现在才有了点头绪。”
柯南的下巴枕在赤井秀一的小臂上，看着赤井秀一手中翻过的文件，扬声问：“地下城？”
矢川明抑扬顿挫地叹了口气。
“宫纪的父亲是个考古学家，在车祸的前两年，他偶然和朋友谈到‘我好像发现了一座地下城’。这是原话，在这之后的一年里，他杳无踪迹。再一次回到人们的视野，就是那一场带走他生命的车祸。”
矢川明的指骨按着桌面，身体微微前倾：“isle俱乐部的中心也在一座神社的地下，你们觉得这是个巧合吗？”
“你们认为，宫纪父亲发现的那座地下城，就是组织的实验室？”柯南向后靠坐在沙发上，双手支在颌前，脑子里闪过无数猜测，“完全有可能……如果乌丸莲耶在四十多年前就和政商界名流有所勾结，以他们的财力完全有可能建立一座地下实验室。”
柯南想起那座由黄金所铸的，熠熠生辉的黄昏别馆，所有事关组织的关键线索在脑海里串联。
通过重新审视17年前的羽田案，他得到了关于乌丸莲耶的线索。在那起事件里，组织暗杀了阿曼达，让羽田浩司服用了A药。
23年前，宫纪的出生伴随着一个考古学家和科研者的死亡。
不对，考古学家的死亡？
血腥碎片和谜局在柯南脑子里奔袭而过，过去的探索和解密，一段段似真非真的故事轰然炸响，他的意识回到了黄昏别馆，老人松弛的脸，棋盘和扑克牌，爱恨和欲望，在血腥暴力的夜晚浮现。
40年前的字谜，雨夜里的暴徒，干化的血迹……黄昏别馆里的两段故事如交织的双链，串联起一段埋藏在陈旧时光里的往事。
“来自警视厅的消息称，40年前，乌丸莲耶在黄昏别馆举办了一场盛大的拍卖会，众多社会名流横死当场。”
“等等你在说什么……”
柯南的手指抵着额头，声带因逐渐迫近的真相紧绷，“但是，千间恭介却说，40年前，乌丸莲耶邀请了一群考古学家在黄昏别馆寻找宝藏，为什么是考古学家？”
矢川明伸出手：“你等一下，乌丸莲耶又是谁？怎么听起来这么熟悉？”
“去问黑田管理官。”赤井秀一和柯南同时站起身，“我们得去一趟黄昏别馆，就现在！”
组织建立在50年前；40年前，黄昏别馆惨案不久后，100岁高龄的乌丸莲耶宣告死亡。
23年前，又一位考古学家兴致勃勃地同朋友宣告自己找到了一座地下城，随后就被组织暗杀。
22年前，宫野厚司和宫野爱莲娜加入组织；
17年前，乌丸莲耶——这个“死者”的姓名再度出现在一面镜子上；
一年半以前，负责APTX-4869的宫野志保从组织逃走；
几个月前，宫纪被组织带走。
“你们怎么不早说啊！”矢川明一把抄起资料跟他们冲出了办公室，一路抓狂地大喊，“不是说好共享情报的吗？”
“一个死人有什么好说的。”柯南也喊，“除了APTX-4869的研发，组织所属的地下